Protein–RNA interactions for Protein: Q93100

PHKB, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKBQ93100 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHKBQ93100 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHKBQ93100 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHKBQ93100 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHKBQ93100 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PHKBQ93100 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHKBQ93100 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHKBQ93100 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHKBQ93100 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHKBQ93100 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PHKBQ93100 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHKBQ93100 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHKBQ93100 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHKBQ93100 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHKBQ93100 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHKBQ93100 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHKBQ93100 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PHKBQ93100 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHKBQ93100 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHKBQ93100 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHKBQ93100 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHKBQ93100 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHKBQ93100 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHKBQ93100 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PHKBQ93100 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHKBQ93100 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHKBQ93100 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHKBQ93100 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHKBQ93100 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHKBQ93100 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHKBQ93100 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PHKBQ93100 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHKBQ93100 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHKBQ93100 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PHKBQ93100 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHKBQ93100 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHKBQ93100 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHKBQ93100 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHKBQ93100 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHKBQ93100 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHKBQ93100 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHKBQ93100 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHKBQ93100 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHKBQ93100 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHKBQ93100 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PHKBQ93100 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PHKBQ93100 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHKBQ93100 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHKBQ93100 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHKBQ93100 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHKBQ93100 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHKBQ93100 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHKBQ93100 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHKBQ93100 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHKBQ93100 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHKBQ93100 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.6 ms