Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CELF1Q92879 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CELF1Q92879 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CELF1Q92879 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CELF1Q92879 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CELF1Q92879 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CELF1Q92879 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CELF1Q92879 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CELF1Q92879 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CELF1Q92879 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CELF1Q92879 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CELF1Q92879 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CELF1Q92879 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CELF1Q92879 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CELF1Q92879 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CELF1Q92879 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CELF1Q92879 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CELF1Q92879 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CELF1Q92879 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CELF1Q92879 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CELF1Q92879 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CELF1Q92879 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CELF1Q92879 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CELF1Q92879 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CELF1Q92879 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CELF1Q92879 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CELF1Q92879 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CELF1Q92879 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CELF1Q92879 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CELF1Q92879 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CELF1Q92879 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CELF1Q92879 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CELF1Q92879 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CELF1Q92879 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CELF1Q92879 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CELF1Q92879 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CELF1Q92879 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CELF1Q92879 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CELF1Q92879 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CELF1Q92879 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CELF1Q92879 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CELF1Q92879 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CELF1Q92879 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CELF1Q92879 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CELF1Q92879 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CELF1Q92879 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CELF1Q92879 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CELF1Q92879 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CELF1Q92879 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CELF1Q92879 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CELF1Q92879 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CELF1Q92879 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CELF1Q92879 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CELF1Q92879 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CELF1Q92879 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CELF1Q92879 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CELF1Q92879 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CELF1Q92879 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CELF1Q92879 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CELF1Q92879 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CELF1Q92879 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CELF1Q92879 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CELF1Q92879 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CELF1Q92879 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CELF1Q92879 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CELF1Q92879 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CELF1Q92879 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CELF1Q92879 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CELF1Q92879 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CELF1Q92879 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CELF1Q92879 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CELF1Q92879 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CELF1Q92879 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CELF1Q92879 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CELF1Q92879 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CELF1Q92879 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CELF1Q92879 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CELF1Q92879 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CELF1Q92879 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CELF1Q92879 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CELF1Q92879 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CELF1Q92879 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CELF1Q92879 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CELF1Q92879 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CELF1Q92879 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CELF1Q92879 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CELF1Q92879 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CELF1Q92879 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CELF1Q92879 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CELF1Q92879 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CELF1Q92879 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CELF1Q92879 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CELF1Q92879 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CELF1Q92879 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CELF1Q92879 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CELF1Q92879 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CELF1Q92879 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CELF1Q92879 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CELF1Q92879 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CELF1Q92879 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms