Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCOLN3Q8TDD5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms