Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2H9

PELI3, E3 ubiquitin-protein ligase pellino homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PELI3Q8N2H9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PELI3Q8N2H9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PELI3Q8N2H9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PELI3Q8N2H9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PELI3Q8N2H9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PELI3Q8N2H9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PELI3Q8N2H9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PELI3Q8N2H9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PELI3Q8N2H9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PELI3Q8N2H9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PELI3Q8N2H9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PELI3Q8N2H9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PELI3Q8N2H9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PELI3Q8N2H9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PELI3Q8N2H9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PELI3Q8N2H9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PELI3Q8N2H9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PELI3Q8N2H9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PELI3Q8N2H9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PELI3Q8N2H9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PELI3Q8N2H9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PELI3Q8N2H9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PELI3Q8N2H9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PELI3Q8N2H9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PELI3Q8N2H9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PELI3Q8N2H9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PELI3Q8N2H9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PELI3Q8N2H9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PELI3Q8N2H9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PELI3Q8N2H9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PELI3Q8N2H9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PELI3Q8N2H9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PELI3Q8N2H9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PELI3Q8N2H9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PELI3Q8N2H9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PELI3Q8N2H9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PELI3Q8N2H9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PELI3Q8N2H9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PELI3Q8N2H9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PELI3Q8N2H9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PELI3Q8N2H9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PELI3Q8N2H9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PELI3Q8N2H9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PELI3Q8N2H9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PELI3Q8N2H9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PELI3Q8N2H9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PELI3Q8N2H9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PELI3Q8N2H9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms