Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NLRP13Q86W25 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
NLRP13Q86W25 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
NLRP13Q86W25 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NLRP13Q86W25 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NLRP13Q86W25 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
NLRP13Q86W25 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NLRP13Q86W25 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NLRP13Q86W25 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NLRP13Q86W25 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NLRP13Q86W25 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NLRP13Q86W25 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NLRP13Q86W25 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NLRP13Q86W25 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NLRP13Q86W25 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NLRP13Q86W25 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NLRP13Q86W25 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NLRP13Q86W25 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NLRP13Q86W25 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
NLRP13Q86W25 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NLRP13Q86W25 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
NLRP13Q86W25 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NLRP13Q86W25 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NLRP13Q86W25 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NLRP13Q86W25 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NLRP13Q86W25 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC32.57■■■□□ 2.8
NLRP13Q86W25 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NLRP13Q86W25 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NLRP13Q86W25 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NLRP13Q86W25 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NLRP13Q86W25 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NLRP13Q86W25 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NLRP13Q86W25 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NLRP13Q86W25 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NLRP13Q86W25 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NLRP13Q86W25 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NLRP13Q86W25 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NLRP13Q86W25 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NLRP13Q86W25 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NLRP13Q86W25 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
NLRP13Q86W25 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NLRP13Q86W25 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NLRP13Q86W25 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NLRP13Q86W25 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NLRP13Q86W25 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NLRP13Q86W25 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NLRP13Q86W25 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NLRP13Q86W25 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NLRP13Q86W25 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NLRP13Q86W25 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NLRP13Q86W25 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NLRP13Q86W25 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NLRP13Q86W25 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NLRP13Q86W25 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NLRP13Q86W25 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NLRP13Q86W25 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NLRP13Q86W25 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NLRP13Q86W25 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
NLRP13Q86W25 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NLRP13Q86W25 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NLRP13Q86W25 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NLRP13Q86W25 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NLRP13Q86W25 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NLRP13Q86W25 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NLRP13Q86W25 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NLRP13Q86W25 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NLRP13Q86W25 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NLRP13Q86W25 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NLRP13Q86W25 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NLRP13Q86W25 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NLRP13Q86W25 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NLRP13Q86W25 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NLRP13Q86W25 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NLRP13Q86W25 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NLRP13Q86W25 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NLRP13Q86W25 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NLRP13Q86W25 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NLRP13Q86W25 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NLRP13Q86W25 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NLRP13Q86W25 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NLRP13Q86W25 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NLRP13Q86W25 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NLRP13Q86W25 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NLRP13Q86W25 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NLRP13Q86W25 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NLRP13Q86W25 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NLRP13Q86W25 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
NLRP13Q86W25 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NLRP13Q86W25 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
NLRP13Q86W25 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NLRP13Q86W25 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NLRP13Q86W25 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NLRP13Q86W25 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NLRP13Q86W25 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NLRP13Q86W25 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NLRP13Q86W25 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NLRP13Q86W25 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms