Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4I7

LIMS2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS2Q7Z4I7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIMS2Q7Z4I7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIMS2Q7Z4I7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIMS2Q7Z4I7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIMS2Q7Z4I7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIMS2Q7Z4I7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LIMS2Q7Z4I7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LIMS2Q7Z4I7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LIMS2Q7Z4I7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LIMS2Q7Z4I7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LIMS2Q7Z4I7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LIMS2Q7Z4I7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LIMS2Q7Z4I7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LIMS2Q7Z4I7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LIMS2Q7Z4I7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LIMS2Q7Z4I7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LIMS2Q7Z4I7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LIMS2Q7Z4I7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LIMS2Q7Z4I7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LIMS2Q7Z4I7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LIMS2Q7Z4I7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LIMS2Q7Z4I7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIMS2Q7Z4I7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIMS2Q7Z4I7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIMS2Q7Z4I7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIMS2Q7Z4I7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIMS2Q7Z4I7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LIMS2Q7Z4I7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LIMS2Q7Z4I7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIMS2Q7Z4I7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIMS2Q7Z4I7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIMS2Q7Z4I7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIMS2Q7Z4I7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIMS2Q7Z4I7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIMS2Q7Z4I7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIMS2Q7Z4I7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIMS2Q7Z4I7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIMS2Q7Z4I7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIMS2Q7Z4I7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIMS2Q7Z4I7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIMS2Q7Z4I7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LIMS2Q7Z4I7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LIMS2Q7Z4I7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LIMS2Q7Z4I7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LIMS2Q7Z4I7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LIMS2Q7Z4I7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LIMS2Q7Z4I7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LIMS2Q7Z4I7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LIMS2Q7Z4I7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LIMS2Q7Z4I7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LIMS2Q7Z4I7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LIMS2Q7Z4I7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIMS2Q7Z4I7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIMS2Q7Z4I7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIMS2Q7Z4I7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIMS2Q7Z4I7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIMS2Q7Z4I7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIMS2Q7Z4I7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIMS2Q7Z4I7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIMS2Q7Z4I7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIMS2Q7Z4I7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIMS2Q7Z4I7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIMS2Q7Z4I7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIMS2Q7Z4I7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIMS2Q7Z4I7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIMS2Q7Z4I7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIMS2Q7Z4I7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIMS2Q7Z4I7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIMS2Q7Z4I7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIMS2Q7Z4I7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIMS2Q7Z4I7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIMS2Q7Z4I7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIMS2Q7Z4I7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIMS2Q7Z4I7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIMS2Q7Z4I7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIMS2Q7Z4I7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIMS2Q7Z4I7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIMS2Q7Z4I7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIMS2Q7Z4I7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIMS2Q7Z4I7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms