Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
LINC00173Q6ZV60 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms