Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDR88Q6ZMY6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.33■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.32■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.32■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.32■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms