Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF7

NXPE4, NXPE family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE4Q6UWF7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXPE4Q6UWF7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXPE4Q6UWF7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXPE4Q6UWF7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXPE4Q6UWF7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXPE4Q6UWF7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXPE4Q6UWF7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXPE4Q6UWF7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NXPE4Q6UWF7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXPE4Q6UWF7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXPE4Q6UWF7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXPE4Q6UWF7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NXPE4Q6UWF7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NXPE4Q6UWF7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NXPE4Q6UWF7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NXPE4Q6UWF7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NXPE4Q6UWF7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NXPE4Q6UWF7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NXPE4Q6UWF7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NXPE4Q6UWF7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NXPE4Q6UWF7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NXPE4Q6UWF7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NXPE4Q6UWF7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NXPE4Q6UWF7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NXPE4Q6UWF7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NXPE4Q6UWF7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NXPE4Q6UWF7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NXPE4Q6UWF7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NXPE4Q6UWF7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NXPE4Q6UWF7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NXPE4Q6UWF7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NXPE4Q6UWF7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NXPE4Q6UWF7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NXPE4Q6UWF7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXPE4Q6UWF7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXPE4Q6UWF7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXPE4Q6UWF7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXPE4Q6UWF7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXPE4Q6UWF7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXPE4Q6UWF7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXPE4Q6UWF7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms