Protein–RNA interactions for Protein: Q63HK3

ZKSCAN2, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 2, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN2Q63HK3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZKSCAN2Q63HK3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZKSCAN2Q63HK3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZKSCAN2Q63HK3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
ZKSCAN2Q63HK3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZKSCAN2Q63HK3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZKSCAN2Q63HK3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZKSCAN2Q63HK3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZKSCAN2Q63HK3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZKSCAN2Q63HK3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZKSCAN2Q63HK3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZKSCAN2Q63HK3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZKSCAN2Q63HK3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZKSCAN2Q63HK3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZKSCAN2Q63HK3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZKSCAN2Q63HK3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
ZKSCAN2Q63HK3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZKSCAN2Q63HK3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZKSCAN2Q63HK3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZKSCAN2Q63HK3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZKSCAN2Q63HK3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZKSCAN2Q63HK3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZKSCAN2Q63HK3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZKSCAN2Q63HK3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZKSCAN2Q63HK3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZKSCAN2Q63HK3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ZKSCAN2Q63HK3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ZKSCAN2Q63HK3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ZKSCAN2Q63HK3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ZKSCAN2Q63HK3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ZKSCAN2Q63HK3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ZKSCAN2Q63HK3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ZKSCAN2Q63HK3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ZKSCAN2Q63HK3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ZKSCAN2Q63HK3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ZKSCAN2Q63HK3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZKSCAN2Q63HK3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZKSCAN2Q63HK3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZKSCAN2Q63HK3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZKSCAN2Q63HK3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZKSCAN2Q63HK3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZKSCAN2Q63HK3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZKSCAN2Q63HK3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZKSCAN2Q63HK3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZKSCAN2Q63HK3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZKSCAN2Q63HK3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZKSCAN2Q63HK3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
ZKSCAN2Q63HK3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZKSCAN2Q63HK3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
ZKSCAN2Q63HK3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZKSCAN2Q63HK3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZKSCAN2Q63HK3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZKSCAN2Q63HK3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZKSCAN2Q63HK3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZKSCAN2Q63HK3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZKSCAN2Q63HK3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZKSCAN2Q63HK3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZKSCAN2Q63HK3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
ZKSCAN2Q63HK3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZKSCAN2Q63HK3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZKSCAN2Q63HK3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZKSCAN2Q63HK3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZKSCAN2Q63HK3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZKSCAN2Q63HK3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZKSCAN2Q63HK3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZKSCAN2Q63HK3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
ZKSCAN2Q63HK3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZKSCAN2Q63HK3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZKSCAN2Q63HK3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZKSCAN2Q63HK3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZKSCAN2Q63HK3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZKSCAN2Q63HK3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZKSCAN2Q63HK3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZKSCAN2Q63HK3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZKSCAN2Q63HK3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZKSCAN2Q63HK3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZKSCAN2Q63HK3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZKSCAN2Q63HK3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZKSCAN2Q63HK3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZKSCAN2Q63HK3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ZKSCAN2Q63HK3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ZKSCAN2Q63HK3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZKSCAN2Q63HK3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZKSCAN2Q63HK3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZKSCAN2Q63HK3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZKSCAN2Q63HK3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZKSCAN2Q63HK3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZKSCAN2Q63HK3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZKSCAN2Q63HK3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZKSCAN2Q63HK3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZKSCAN2Q63HK3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZKSCAN2Q63HK3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZKSCAN2Q63HK3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZKSCAN2Q63HK3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
ZKSCAN2Q63HK3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZKSCAN2Q63HK3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms