Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ9

EFCAB2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB2Q5VUJ9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
EFCAB2Q5VUJ9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
EFCAB2Q5VUJ9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
EFCAB2Q5VUJ9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
EFCAB2Q5VUJ9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
EFCAB2Q5VUJ9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
EFCAB2Q5VUJ9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
EFCAB2Q5VUJ9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
EFCAB2Q5VUJ9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
EFCAB2Q5VUJ9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
EFCAB2Q5VUJ9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
EFCAB2Q5VUJ9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
EFCAB2Q5VUJ9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
EFCAB2Q5VUJ9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
EFCAB2Q5VUJ9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
EFCAB2Q5VUJ9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
EFCAB2Q5VUJ9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
EFCAB2Q5VUJ9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
EFCAB2Q5VUJ9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
EFCAB2Q5VUJ9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
EFCAB2Q5VUJ9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
EFCAB2Q5VUJ9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
EFCAB2Q5VUJ9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
EFCAB2Q5VUJ9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
EFCAB2Q5VUJ9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
EFCAB2Q5VUJ9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
EFCAB2Q5VUJ9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
EFCAB2Q5VUJ9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
EFCAB2Q5VUJ9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
EFCAB2Q5VUJ9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.07■■■■□ 3.36
EFCAB2Q5VUJ9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
EFCAB2Q5VUJ9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
EFCAB2Q5VUJ9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
EFCAB2Q5VUJ9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
EFCAB2Q5VUJ9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
EFCAB2Q5VUJ9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
EFCAB2Q5VUJ9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
EFCAB2Q5VUJ9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
EFCAB2Q5VUJ9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
EFCAB2Q5VUJ9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
EFCAB2Q5VUJ9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
EFCAB2Q5VUJ9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
EFCAB2Q5VUJ9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
EFCAB2Q5VUJ9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
EFCAB2Q5VUJ9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
EFCAB2Q5VUJ9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
EFCAB2Q5VUJ9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
EFCAB2Q5VUJ9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
EFCAB2Q5VUJ9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
EFCAB2Q5VUJ9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
EFCAB2Q5VUJ9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
EFCAB2Q5VUJ9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC36■■■■□ 3.35
EFCAB2Q5VUJ9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
EFCAB2Q5VUJ9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
EFCAB2Q5VUJ9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
EFCAB2Q5VUJ9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
EFCAB2Q5VUJ9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
EFCAB2Q5VUJ9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
EFCAB2Q5VUJ9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
EFCAB2Q5VUJ9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
EFCAB2Q5VUJ9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
EFCAB2Q5VUJ9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
EFCAB2Q5VUJ9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
EFCAB2Q5VUJ9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
EFCAB2Q5VUJ9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
EFCAB2Q5VUJ9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
EFCAB2Q5VUJ9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
EFCAB2Q5VUJ9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
EFCAB2Q5VUJ9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
EFCAB2Q5VUJ9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
EFCAB2Q5VUJ9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
EFCAB2Q5VUJ9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
EFCAB2Q5VUJ9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
EFCAB2Q5VUJ9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
EFCAB2Q5VUJ9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
EFCAB2Q5VUJ9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
EFCAB2Q5VUJ9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
EFCAB2Q5VUJ9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
EFCAB2Q5VUJ9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
EFCAB2Q5VUJ9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
EFCAB2Q5VUJ9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
EFCAB2Q5VUJ9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
EFCAB2Q5VUJ9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
EFCAB2Q5VUJ9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
EFCAB2Q5VUJ9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
EFCAB2Q5VUJ9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
EFCAB2Q5VUJ9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
EFCAB2Q5VUJ9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
EFCAB2Q5VUJ9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
EFCAB2Q5VUJ9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
EFCAB2Q5VUJ9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
EFCAB2Q5VUJ9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
EFCAB2Q5VUJ9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
EFCAB2Q5VUJ9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
EFCAB2Q5VUJ9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
EFCAB2Q5VUJ9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
EFCAB2Q5VUJ9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms