Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQN1

SNAP47, Synaptosomal-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP47Q5SQN1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
SNAP47Q5SQN1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP47Q5SQN1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP47Q5SQN1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP47Q5SQN1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP47Q5SQN1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP47Q5SQN1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP47Q5SQN1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP47Q5SQN1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP47Q5SQN1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP47Q5SQN1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP47Q5SQN1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP47Q5SQN1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP47Q5SQN1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP47Q5SQN1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP47Q5SQN1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP47Q5SQN1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP47Q5SQN1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP47Q5SQN1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP47Q5SQN1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP47Q5SQN1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP47Q5SQN1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP47Q5SQN1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP47Q5SQN1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP47Q5SQN1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP47Q5SQN1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP47Q5SQN1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP47Q5SQN1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP47Q5SQN1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP47Q5SQN1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP47Q5SQN1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP47Q5SQN1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP47Q5SQN1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP47Q5SQN1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP47Q5SQN1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP47Q5SQN1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP47Q5SQN1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP47Q5SQN1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP47Q5SQN1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP47Q5SQN1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP47Q5SQN1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP47Q5SQN1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP47Q5SQN1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP47Q5SQN1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms