Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC158Q5M9N0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC158Q5M9N0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC158Q5M9N0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC158Q5M9N0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC158Q5M9N0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC158Q5M9N0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC158Q5M9N0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC158Q5M9N0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC158Q5M9N0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC158Q5M9N0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC158Q5M9N0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC158Q5M9N0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC158Q5M9N0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC158Q5M9N0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC158Q5M9N0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC158Q5M9N0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC158Q5M9N0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC158Q5M9N0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC158Q5M9N0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC158Q5M9N0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC158Q5M9N0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC158Q5M9N0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC158Q5M9N0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC158Q5M9N0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC158Q5M9N0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC158Q5M9N0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC158Q5M9N0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC158Q5M9N0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC158Q5M9N0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC158Q5M9N0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC158Q5M9N0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC158Q5M9N0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC158Q5M9N0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC158Q5M9N0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC158Q5M9N0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC158Q5M9N0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC158Q5M9N0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC158Q5M9N0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC158Q5M9N0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC158Q5M9N0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC158Q5M9N0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC158Q5M9N0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC158Q5M9N0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC158Q5M9N0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC158Q5M9N0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC158Q5M9N0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC158Q5M9N0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC158Q5M9N0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC158Q5M9N0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC158Q5M9N0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC158Q5M9N0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC158Q5M9N0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC158Q5M9N0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC158Q5M9N0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC158Q5M9N0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC158Q5M9N0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC158Q5M9N0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC158Q5M9N0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC158Q5M9N0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC158Q5M9N0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC158Q5M9N0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC158Q5M9N0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC158Q5M9N0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC158Q5M9N0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC158Q5M9N0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC158Q5M9N0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC158Q5M9N0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC158Q5M9N0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC158Q5M9N0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC158Q5M9N0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
CCDC158Q5M9N0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC158Q5M9N0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC158Q5M9N0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC158Q5M9N0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC158Q5M9N0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC158Q5M9N0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC158Q5M9N0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC158Q5M9N0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC158Q5M9N0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC158Q5M9N0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC158Q5M9N0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC158Q5M9N0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC158Q5M9N0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC158Q5M9N0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC158Q5M9N0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC158Q5M9N0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC158Q5M9N0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC158Q5M9N0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC158Q5M9N0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC158Q5M9N0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC158Q5M9N0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC158Q5M9N0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC158Q5M9N0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC158Q5M9N0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC158Q5M9N0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC158Q5M9N0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC158Q5M9N0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC158Q5M9N0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC158Q5M9N0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms