Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC38Q502W7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC38Q502W7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms