Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SSX2Q16385 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSX2Q16385 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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