Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB35Q15286 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB35Q15286 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB35Q15286 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB35Q15286 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB35Q15286 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB35Q15286 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAB35Q15286 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAB35Q15286 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAB35Q15286 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAB35Q15286 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB35Q15286 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms