Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKD1Q15139 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKD1Q15139 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKD1Q15139 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKD1Q15139 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKD1Q15139 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKD1Q15139 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKD1Q15139 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKD1Q15139 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKD1Q15139 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKD1Q15139 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKD1Q15139 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKD1Q15139 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKD1Q15139 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms