Protein–RNA interactions for Protein: Q14517

FAT1, Protocadherin Fat 1, humanhuman

Predictions only

Length 4,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT1Q14517 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FAT1Q14517 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAT1Q14517 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FAT1Q14517 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
FAT1Q14517 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAT1Q14517 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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FAT1Q14517 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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FAT1Q14517 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAT1Q14517 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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FAT1Q14517 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAT1Q14517 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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FAT1Q14517 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAT1Q14517 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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FAT1Q14517 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAT1Q14517 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAT1Q14517 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAT1Q14517 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAT1Q14517 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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FAT1Q14517 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAT1Q14517 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAT1Q14517 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAT1Q14517 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAT1Q14517 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAT1Q14517 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAT1Q14517 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAT1Q14517 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAT1Q14517 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAT1Q14517 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAT1Q14517 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAT1Q14517 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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