Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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