Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTP4A2Q12974 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTP4A2Q12974 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTP4A2Q12974 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTP4A2Q12974 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTP4A2Q12974 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTP4A2Q12974 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTP4A2Q12974 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTP4A2Q12974 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTP4A2Q12974 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTP4A2Q12974 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTP4A2Q12974 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTP4A2Q12974 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTP4A2Q12974 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTP4A2Q12974 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTP4A2Q12974 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTP4A2Q12974 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTP4A2Q12974 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTP4A2Q12974 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTP4A2Q12974 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
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