Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KCNA1Q09470 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
KCNA1Q09470 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNA1Q09470 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNA1Q09470 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNA1Q09470 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNA1Q09470 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNA1Q09470 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNA1Q09470 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNA1Q09470 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNA1Q09470 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNA1Q09470 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNA1Q09470 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNA1Q09470 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNA1Q09470 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNA1Q09470 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNA1Q09470 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNA1Q09470 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNA1Q09470 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNA1Q09470 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNA1Q09470 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNA1Q09470 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNA1Q09470 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNA1Q09470 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNA1Q09470 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNA1Q09470 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNA1Q09470 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNA1Q09470 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNA1Q09470 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNA1Q09470 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNA1Q09470 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNA1Q09470 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNA1Q09470 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNA1Q09470 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNA1Q09470 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNA1Q09470 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNA1Q09470 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNA1Q09470 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNA1Q09470 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNA1Q09470 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNA1Q09470 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNA1Q09470 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNA1Q09470 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
KCNA1Q09470 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNA1Q09470 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNA1Q09470 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNA1Q09470 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNA1Q09470 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNA1Q09470 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms