Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPOCK1Q08629 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPOCK1Q08629 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms