Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC63Q05C16 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC63Q05C16 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC63Q05C16 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC63Q05C16 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC63Q05C16 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC63Q05C16 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC63Q05C16 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC63Q05C16 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC63Q05C16 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC63Q05C16 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC63Q05C16 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC63Q05C16 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC63Q05C16 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC63Q05C16 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC63Q05C16 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC63Q05C16 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC63Q05C16 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC63Q05C16 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC63Q05C16 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
LRRC63Q05C16 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRRC63Q05C16 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC63Q05C16 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC63Q05C16 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC63Q05C16 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC63Q05C16 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC63Q05C16 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC63Q05C16 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC63Q05C16 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC63Q05C16 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC63Q05C16 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC63Q05C16 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC63Q05C16 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC63Q05C16 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC63Q05C16 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC63Q05C16 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC63Q05C16 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC63Q05C16 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC63Q05C16 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC63Q05C16 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC63Q05C16 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC63Q05C16 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC63Q05C16 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC63Q05C16 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC63Q05C16 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC63Q05C16 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC63Q05C16 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.9 ms