Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE3AQ05086 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE3AQ05086 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE3AQ05086 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE3AQ05086 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE3AQ05086 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE3AQ05086 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE3AQ05086 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBE3AQ05086 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE3AQ05086 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE3AQ05086 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms