Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms