Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
ERCC6Q03468 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
ERCC6Q03468 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC41.23■■■■■ 4.19
ERCC6Q03468 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
ERCC6Q03468 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
ERCC6Q03468 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
ERCC6Q03468 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
ERCC6Q03468 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
ERCC6Q03468 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC41.22■■■■■ 4.19
ERCC6Q03468 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
ERCC6Q03468 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
ERCC6Q03468 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.21■■■■■ 4.19
ERCC6Q03468 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC41.21■■■■■ 4.19
ERCC6Q03468 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC41.21■■■■■ 4.19
ERCC6Q03468 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC41.21■■■■■ 4.19
ERCC6Q03468 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
ERCC6Q03468 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
ERCC6Q03468 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
ERCC6Q03468 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.19
ERCC6Q03468 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
ERCC6Q03468 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
ERCC6Q03468 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
ERCC6Q03468 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
ERCC6Q03468 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
ERCC6Q03468 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
ERCC6Q03468 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC41.18■■■■■ 4.18
ERCC6Q03468 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
ERCC6Q03468 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
ERCC6Q03468 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
ERCC6Q03468 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
ERCC6Q03468 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC41.17■■■■■ 4.18
ERCC6Q03468 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
ERCC6Q03468 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
ERCC6Q03468 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
ERCC6Q03468 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
ERCC6Q03468 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.16■■■■■ 4.18
ERCC6Q03468 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
ERCC6Q03468 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
ERCC6Q03468 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
ERCC6Q03468 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
ERCC6Q03468 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC41.15■■■■■ 4.18
ERCC6Q03468 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC41.15■■■■■ 4.18
ERCC6Q03468 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
ERCC6Q03468 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
ERCC6Q03468 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
ERCC6Q03468 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC41.14■■■■■ 4.18
ERCC6Q03468 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC41.14■■■■■ 4.18
ERCC6Q03468 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC41.13■■■■■ 4.18
ERCC6Q03468 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
ERCC6Q03468 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC41.13■■■■■ 4.17
ERCC6Q03468 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC41.13■■■■■ 4.17
ERCC6Q03468 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
ERCC6Q03468 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
ERCC6Q03468 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC41.12■■■■■ 4.17
ERCC6Q03468 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
ERCC6Q03468 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
ERCC6Q03468 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
ERCC6Q03468 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
ERCC6Q03468 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
ERCC6Q03468 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
ERCC6Q03468 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
ERCC6Q03468 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
ERCC6Q03468 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
ERCC6Q03468 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
ERCC6Q03468 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
ERCC6Q03468 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
ERCC6Q03468 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
ERCC6Q03468 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
ERCC6Q03468 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
ERCC6Q03468 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
ERCC6Q03468 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
ERCC6Q03468 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC41.09■■■■■ 4.17
ERCC6Q03468 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
ERCC6Q03468 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
ERCC6Q03468 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
ERCC6Q03468 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
ERCC6Q03468 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC41.08■■■■■ 4.17
ERCC6Q03468 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
ERCC6Q03468 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
ERCC6Q03468 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
ERCC6Q03468 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
ERCC6Q03468 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
ERCC6Q03468 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
ERCC6Q03468 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
ERCC6Q03468 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
ERCC6Q03468 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
ERCC6Q03468 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
ERCC6Q03468 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
ERCC6Q03468 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
ERCC6Q03468 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
ERCC6Q03468 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
ERCC6Q03468 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
ERCC6Q03468 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
ERCC6Q03468 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
ERCC6Q03468 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
ERCC6Q03468 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
ERCC6Q03468 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
ERCC6Q03468 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
ERCC6Q03468 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC41.01■■■■■ 4.16
ERCC6Q03468 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms