Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
OTUD4Q01804 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTUD4Q01804 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTUD4Q01804 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTUD4Q01804 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTUD4Q01804 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTUD4Q01804 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
OTUD4Q01804 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTUD4Q01804 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTUD4Q01804 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTUD4Q01804 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTUD4Q01804 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTUD4Q01804 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUD4Q01804 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUD4Q01804 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUD4Q01804 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUD4Q01804 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUD4Q01804 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD4Q01804 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD4Q01804 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD4Q01804 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD4Q01804 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD4Q01804 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD4Q01804 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD4Q01804 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD4Q01804 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD4Q01804 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD4Q01804 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD4Q01804 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD4Q01804 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms