Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FANCCQ00597 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FANCCQ00597 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FANCCQ00597 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FANCCQ00597 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FANCCQ00597 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FANCCQ00597 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FANCCQ00597 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
FANCCQ00597 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FANCCQ00597 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FANCCQ00597 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FANCCQ00597 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FANCCQ00597 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FANCCQ00597 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FANCCQ00597 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FANCCQ00597 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FANCCQ00597 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FANCCQ00597 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FANCCQ00597 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FANCCQ00597 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FANCCQ00597 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FANCCQ00597 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FANCCQ00597 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FANCCQ00597 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FANCCQ00597 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FANCCQ00597 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FANCCQ00597 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FANCCQ00597 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FANCCQ00597 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FANCCQ00597 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FANCCQ00597 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FANCCQ00597 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FANCCQ00597 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
FANCCQ00597 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FANCCQ00597 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
FANCCQ00597 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FANCCQ00597 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FANCCQ00597 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FANCCQ00597 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
FANCCQ00597 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms