Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFNB1P98172 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms