Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ELF3P78545 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ELF3P78545 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ELF3P78545 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ELF3P78545 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ELF3P78545 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ELF3P78545 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ELF3P78545 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ELF3P78545 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ELF3P78545 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ELF3P78545 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ELF3P78545 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ELF3P78545 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ELF3P78545 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ELF3P78545 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ELF3P78545 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ELF3P78545 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ELF3P78545 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ELF3P78545 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ELF3P78545 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ELF3P78545 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ELF3P78545 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ELF3P78545 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ELF3P78545 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ELF3P78545 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELF3P78545 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELF3P78545 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELF3P78545 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ELF3P78545 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ELF3P78545 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELF3P78545 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELF3P78545 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELF3P78545 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELF3P78545 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELF3P78545 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELF3P78545 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELF3P78545 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELF3P78545 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELF3P78545 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELF3P78545 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELF3P78545 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELF3P78545 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELF3P78545 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELF3P78545 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELF3P78545 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELF3P78545 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELF3P78545 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELF3P78545 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELF3P78545 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELF3P78545 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELF3P78545 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ELF3P78545 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELF3P78545 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELF3P78545 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELF3P78545 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELF3P78545 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELF3P78545 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ELF3P78545 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ELF3P78545 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ELF3P78545 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ELF3P78545 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ELF3P78545 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ELF3P78545 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ELF3P78545 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ELF3P78545 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ELF3P78545 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ELF3P78545 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ELF3P78545 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ELF3P78545 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ELF3P78545 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ELF3P78545 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELF3P78545 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELF3P78545 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELF3P78545 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELF3P78545 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELF3P78545 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELF3P78545 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELF3P78545 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELF3P78545 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ELF3P78545 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ELF3P78545 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELF3P78545 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELF3P78545 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELF3P78545 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELF3P78545 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELF3P78545 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELF3P78545 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELF3P78545 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ELF3P78545 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELF3P78545 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELF3P78545 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELF3P78545 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELF3P78545 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELF3P78545 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELF3P78545 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELF3P78545 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELF3P78545 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELF3P78545 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELF3P78545 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELF3P78545 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms