Protein–RNA interactions for Protein: P54840

GYS2, Glycogen [starch] synthase, liver, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS2P54840 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GYS2P54840 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GYS2P54840 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GYS2P54840 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GYS2P54840 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GYS2P54840 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GYS2P54840 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GYS2P54840 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GYS2P54840 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GYS2P54840 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GYS2P54840 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GYS2P54840 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GYS2P54840 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GYS2P54840 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GYS2P54840 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GYS2P54840 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GYS2P54840 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GYS2P54840 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GYS2P54840 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GYS2P54840 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GYS2P54840 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GYS2P54840 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GYS2P54840 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GYS2P54840 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GYS2P54840 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GYS2P54840 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GYS2P54840 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GYS2P54840 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GYS2P54840 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GYS2P54840 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GYS2P54840 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GYS2P54840 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GYS2P54840 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GYS2P54840 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GYS2P54840 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GYS2P54840 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GYS2P54840 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GYS2P54840 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GYS2P54840 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GYS2P54840 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GYS2P54840 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GYS2P54840 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GYS2P54840 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GYS2P54840 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GYS2P54840 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GYS2P54840 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GYS2P54840 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GYS2P54840 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GYS2P54840 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GYS2P54840 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GYS2P54840 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GYS2P54840 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GYS2P54840 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GYS2P54840 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GYS2P54840 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GYS2P54840 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GYS2P54840 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GYS2P54840 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GYS2P54840 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GYS2P54840 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GYS2P54840 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GYS2P54840 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GYS2P54840 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GYS2P54840 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GYS2P54840 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GYS2P54840 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GYS2P54840 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GYS2P54840 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GYS2P54840 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GYS2P54840 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GYS2P54840 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GYS2P54840 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GYS2P54840 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GYS2P54840 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GYS2P54840 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GYS2P54840 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GYS2P54840 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GYS2P54840 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GYS2P54840 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GYS2P54840 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GYS2P54840 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GYS2P54840 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GYS2P54840 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GYS2P54840 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GYS2P54840 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GYS2P54840 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GYS2P54840 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GYS2P54840 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GYS2P54840 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GYS2P54840 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GYS2P54840 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GYS2P54840 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GYS2P54840 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GYS2P54840 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GYS2P54840 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GYS2P54840 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GYS2P54840 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GYS2P54840 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GYS2P54840 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GYS2P54840 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 691.7 ms