Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP5P51878 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP5P51878 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP5P51878 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP5P51878 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP5P51878 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP5P51878 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP5P51878 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP5P51878 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP5P51878 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASP5P51878 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASP5P51878 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASP5P51878 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASP5P51878 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP5P51878 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP5P51878 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP5P51878 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP5P51878 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP5P51878 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP5P51878 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP5P51878 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP5P51878 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP5P51878 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP5P51878 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP5P51878 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP5P51878 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP5P51878 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CASP5P51878 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CASP5P51878 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CASP5P51878 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CASP5P51878 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CASP5P51878 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CASP5P51878 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CASP5P51878 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CASP5P51878 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CASP5P51878 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CASP5P51878 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP5P51878 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP5P51878 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP5P51878 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP5P51878 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP5P51878 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP5P51878 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP5P51878 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP5P51878 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP5P51878 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP5P51878 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP5P51878 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP5P51878 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP5P51878 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP5P51878 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP5P51878 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP5P51878 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP5P51878 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP5P51878 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP5P51878 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP5P51878 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP5P51878 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP5P51878 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP5P51878 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP5P51878 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP5P51878 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASP5P51878 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASP5P51878 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASP5P51878 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CASP5P51878 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP5P51878 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP5P51878 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP5P51878 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP5P51878 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP5P51878 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP5P51878 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP5P51878 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP5P51878 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASP5P51878 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP5P51878 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP5P51878 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP5P51878 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP5P51878 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP5P51878 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP5P51878 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP5P51878 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP5P51878 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP5P51878 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP5P51878 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP5P51878 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP5P51878 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP5P51878 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP5P51878 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP5P51878 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP5P51878 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP5P51878 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP5P51878 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP5P51878 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP5P51878 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP5P51878 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASP5P51878 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASP5P51878 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASP5P51878 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASP5P51878 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms