Protein–RNA interactions for Protein: P51795

CLCN5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN5P51795 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCN5P51795 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCN5P51795 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCN5P51795 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCN5P51795 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCN5P51795 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCN5P51795 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCN5P51795 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCN5P51795 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCN5P51795 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCN5P51795 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCN5P51795 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCN5P51795 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCN5P51795 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCN5P51795 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCN5P51795 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCN5P51795 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCN5P51795 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCN5P51795 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCN5P51795 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCN5P51795 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCN5P51795 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCN5P51795 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCN5P51795 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCN5P51795 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCN5P51795 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCN5P51795 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCN5P51795 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCN5P51795 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCN5P51795 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCN5P51795 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCN5P51795 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCN5P51795 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCN5P51795 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCN5P51795 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCN5P51795 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCN5P51795 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCN5P51795 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCN5P51795 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCN5P51795 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCN5P51795 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCN5P51795 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCN5P51795 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCN5P51795 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCN5P51795 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCN5P51795 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCN5P51795 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCN5P51795 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCN5P51795 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCN5P51795 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCN5P51795 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCN5P51795 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCN5P51795 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCN5P51795 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms