Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP11P51784 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP11P51784 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
USP11P51784 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP11P51784 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP11P51784 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP11P51784 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP11P51784 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP11P51784 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP11P51784 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP11P51784 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP11P51784 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP11P51784 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP11P51784 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP11P51784 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP11P51784 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP11P51784 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP11P51784 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP11P51784 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP11P51784 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP11P51784 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP11P51784 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP11P51784 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP11P51784 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP11P51784 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP11P51784 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP11P51784 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
USP11P51784 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
USP11P51784 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP11P51784 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP11P51784 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP11P51784 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP11P51784 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
USP11P51784 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
USP11P51784 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP11P51784 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP11P51784 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP11P51784 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP11P51784 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP11P51784 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP11P51784 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP11P51784 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP11P51784 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP11P51784 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP11P51784 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP11P51784 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP11P51784 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP11P51784 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP11P51784 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP11P51784 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP11P51784 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP11P51784 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP11P51784 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP11P51784 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP11P51784 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP11P51784 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP11P51784 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP11P51784 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP11P51784 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP11P51784 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP11P51784 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP11P51784 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP11P51784 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP11P51784 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP11P51784 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP11P51784 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP11P51784 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP11P51784 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP11P51784 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP11P51784 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP11P51784 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
USP11P51784 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP11P51784 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP11P51784 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP11P51784 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP11P51784 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP11P51784 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP11P51784 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP11P51784 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP11P51784 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP11P51784 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
USP11P51784 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP11P51784 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP11P51784 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP11P51784 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP11P51784 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP11P51784 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP11P51784 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP11P51784 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP11P51784 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP11P51784 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP11P51784 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP11P51784 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP11P51784 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP11P51784 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
USP11P51784 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP11P51784 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP11P51784 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP11P51784 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP11P51784 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms