Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASQ1P31415 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASQ1P31415 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASQ1P31415 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASQ1P31415 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASQ1P31415 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASQ1P31415 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASQ1P31415 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASQ1P31415 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASQ1P31415 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASQ1P31415 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASQ1P31415 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASQ1P31415 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASQ1P31415 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASQ1P31415 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASQ1P31415 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASQ1P31415 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASQ1P31415 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASQ1P31415 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASQ1P31415 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASQ1P31415 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASQ1P31415 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASQ1P31415 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASQ1P31415 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASQ1P31415 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASQ1P31415 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
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