Protein–RNA interactions for Protein: P29074

PTPN4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4P29074 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPN4P29074 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPN4P29074 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN4P29074 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPN4P29074 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPN4P29074 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN4P29074 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN4P29074 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN4P29074 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN4P29074 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN4P29074 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN4P29074 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN4P29074 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN4P29074 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN4P29074 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN4P29074 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN4P29074 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN4P29074 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN4P29074 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN4P29074 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN4P29074 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN4P29074 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN4P29074 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN4P29074 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN4P29074 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN4P29074 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN4P29074 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN4P29074 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN4P29074 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN4P29074 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN4P29074 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN4P29074 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN4P29074 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN4P29074 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN4P29074 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN4P29074 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN4P29074 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN4P29074 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN4P29074 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN4P29074 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN4P29074 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN4P29074 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN4P29074 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN4P29074 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN4P29074 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms