Protein–RNA interactions for Protein: P26045

PTPN3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3P26045 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPN3P26045 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN3P26045 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN3P26045 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN3P26045 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN3P26045 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN3P26045 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN3P26045 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN3P26045 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN3P26045 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN3P26045 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN3P26045 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN3P26045 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN3P26045 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN3P26045 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN3P26045 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN3P26045 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN3P26045 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN3P26045 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN3P26045 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN3P26045 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN3P26045 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN3P26045 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN3P26045 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN3P26045 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN3P26045 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN3P26045 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN3P26045 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN3P26045 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN3P26045 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN3P26045 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN3P26045 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN3P26045 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms