Protein–RNA interactions for Protein: P24941

CDK2, Cyclin-dependent kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK2P24941 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK2P24941 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK2P24941 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK2P24941 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK2P24941 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK2P24941 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK2P24941 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK2P24941 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK2P24941 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK2P24941 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK2P24941 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK2P24941 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK2P24941 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK2P24941 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK2P24941 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK2P24941 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK2P24941 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK2P24941 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK2P24941 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK2P24941 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK2P24941 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK2P24941 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK2P24941 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK2P24941 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK2P24941 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK2P24941 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK2P24941 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK2P24941 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK2P24941 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK2P24941 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK2P24941 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK2P24941 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK2P24941 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK2P24941 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK2P24941 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK2P24941 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK2P24941 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK2P24941 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK2P24941 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK2P24941 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK2P24941 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK2P24941 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK2P24941 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK2P24941 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK2P24941 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK2P24941 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK2P24941 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK2P24941 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK2P24941 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK2P24941 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK2P24941 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK2P24941 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK2P24941 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK2P24941 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK2P24941 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK2P24941 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK2P24941 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK2P24941 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK2P24941 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK2P24941 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK2P24941 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK2P24941 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK2P24941 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK2P24941 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK2P24941 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK2P24941 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK2P24941 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK2P24941 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK2P24941 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK2P24941 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK2P24941 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK2P24941 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK2P24941 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK2P24941 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK2P24941 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK2P24941 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK2P24941 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK2P24941 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK2P24941 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK2P24941 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK2P24941 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK2P24941 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK2P24941 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK2P24941 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK2P24941 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK2P24941 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK2P24941 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK2P24941 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK2P24941 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK2P24941 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK2P24941 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK2P24941 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK2P24941 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK2P24941 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK2P24941 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK2P24941 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK2P24941 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK2P24941 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK2P24941 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK2P24941 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms