Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRBP23467 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRBP23467 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRBP23467 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRBP23467 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRBP23467 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRBP23467 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRBP23467 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRBP23467 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRBP23467 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRBP23467 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRBP23467 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRBP23467 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRBP23467 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRBP23467 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRBP23467 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRBP23467 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRBP23467 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRBP23467 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRBP23467 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRBP23467 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRBP23467 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRBP23467 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRBP23467 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRBP23467 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRBP23467 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRBP23467 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRBP23467 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRBP23467 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRBP23467 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRBP23467 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRBP23467 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRBP23467 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
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