Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PVALBP20472 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PVALBP20472 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PVALBP20472 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PVALBP20472 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PVALBP20472 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PVALBP20472 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PVALBP20472 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PVALBP20472 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PVALBP20472 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PVALBP20472 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PVALBP20472 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PVALBP20472 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PVALBP20472 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PVALBP20472 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PVALBP20472 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PVALBP20472 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PVALBP20472 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PVALBP20472 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PVALBP20472 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PVALBP20472 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PVALBP20472 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PVALBP20472 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PVALBP20472 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PVALBP20472 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PVALBP20472 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PVALBP20472 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PVALBP20472 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PVALBP20472 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PVALBP20472 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PVALBP20472 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PVALBP20472 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PVALBP20472 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PVALBP20472 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PVALBP20472 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PVALBP20472 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PVALBP20472 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PVALBP20472 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PVALBP20472 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PVALBP20472 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PVALBP20472 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PVALBP20472 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PVALBP20472 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PVALBP20472 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PVALBP20472 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PVALBP20472 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PVALBP20472 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PVALBP20472 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PVALBP20472 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PVALBP20472 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PVALBP20472 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PVALBP20472 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PVALBP20472 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PVALBP20472 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PVALBP20472 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PVALBP20472 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PVALBP20472 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PVALBP20472 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PVALBP20472 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PVALBP20472 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PVALBP20472 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PVALBP20472 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PVALBP20472 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PVALBP20472 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PVALBP20472 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PVALBP20472 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PVALBP20472 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PVALBP20472 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PVALBP20472 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PVALBP20472 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PVALBP20472 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PVALBP20472 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PVALBP20472 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PVALBP20472 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PVALBP20472 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PVALBP20472 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PVALBP20472 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PVALBP20472 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PVALBP20472 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PVALBP20472 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PVALBP20472 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PVALBP20472 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PVALBP20472 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PVALBP20472 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PVALBP20472 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PVALBP20472 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PVALBP20472 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PVALBP20472 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PVALBP20472 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PVALBP20472 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PVALBP20472 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PVALBP20472 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PVALBP20472 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PVALBP20472 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PVALBP20472 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PVALBP20472 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PVALBP20472 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PVALBP20472 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PVALBP20472 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PVALBP20472 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms