Protein–RNA interactions for Protein: P17213

BPI, Bactericidal permeability-increasing protein, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIP17213 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIP17213 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIP17213 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BPIP17213 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BPIP17213 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIP17213 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIP17213 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIP17213 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPIP17213 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPIP17213 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPIP17213 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPIP17213 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPIP17213 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPIP17213 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPIP17213 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIP17213 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIP17213 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIP17213 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIP17213 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIP17213 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIP17213 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIP17213 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIP17213 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIP17213 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIP17213 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIP17213 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIP17213 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPIP17213 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPIP17213 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPIP17213 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPIP17213 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPIP17213 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIP17213 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIP17213 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIP17213 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIP17213 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIP17213 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIP17213 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIP17213 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIP17213 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIP17213 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIP17213 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIP17213 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIP17213 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIP17213 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BPIP17213 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BPIP17213 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BPIP17213 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BPIP17213 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BPIP17213 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BPIP17213 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BPIP17213 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BPIP17213 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BPIP17213 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BPIP17213 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BPIP17213 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BPIP17213 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BPIP17213 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BPIP17213 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BPIP17213 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BPIP17213 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BPIP17213 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BPIP17213 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BPIP17213 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BPIP17213 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BPIP17213 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BPIP17213 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BPIP17213 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BPIP17213 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BPIP17213 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BPIP17213 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BPIP17213 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BPIP17213 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BPIP17213 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BPIP17213 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BPIP17213 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BPIP17213 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BPIP17213 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BPIP17213 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BPIP17213 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BPIP17213 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BPIP17213 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BPIP17213 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BPIP17213 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BPIP17213 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BPIP17213 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BPIP17213 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BPIP17213 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPIP17213 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPIP17213 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPIP17213 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPIP17213 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BPIP17213 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPIP17213 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPIP17213 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPIP17213 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPIP17213 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPIP17213 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BPIP17213 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BPIP17213 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms