Protein–RNA interactions for Protein: P17096

HMGA1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA1P17096 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
HMGA1P17096 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGA1P17096 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGA1P17096 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGA1P17096 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGA1P17096 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGA1P17096 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGA1P17096 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGA1P17096 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGA1P17096 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGA1P17096 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGA1P17096 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGA1P17096 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGA1P17096 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGA1P17096 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGA1P17096 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGA1P17096 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGA1P17096 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGA1P17096 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGA1P17096 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGA1P17096 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGA1P17096 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGA1P17096 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGA1P17096 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGA1P17096 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGA1P17096 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGA1P17096 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGA1P17096 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGA1P17096 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGA1P17096 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGA1P17096 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGA1P17096 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGA1P17096 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGA1P17096 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGA1P17096 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGA1P17096 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGA1P17096 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGA1P17096 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGA1P17096 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGA1P17096 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGA1P17096 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGA1P17096 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGA1P17096 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGA1P17096 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGA1P17096 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGA1P17096 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGA1P17096 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGA1P17096 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGA1P17096 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGA1P17096 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGA1P17096 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGA1P17096 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGA1P17096 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGA1P17096 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGA1P17096 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGA1P17096 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGA1P17096 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGA1P17096 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGA1P17096 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGA1P17096 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGA1P17096 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGA1P17096 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGA1P17096 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGA1P17096 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGA1P17096 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGA1P17096 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGA1P17096 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGA1P17096 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGA1P17096 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGA1P17096 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGA1P17096 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGA1P17096 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGA1P17096 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGA1P17096 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGA1P17096 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGA1P17096 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGA1P17096 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGA1P17096 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGA1P17096 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGA1P17096 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGA1P17096 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.6 ms