Protein–RNA interactions for Protein: P16949

STMN1, Stathmin, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STMN1P16949 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STMN1P16949 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STMN1P16949 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STMN1P16949 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STMN1P16949 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STMN1P16949 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STMN1P16949 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STMN1P16949 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STMN1P16949 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STMN1P16949 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STMN1P16949 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STMN1P16949 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STMN1P16949 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STMN1P16949 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STMN1P16949 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STMN1P16949 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STMN1P16949 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STMN1P16949 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STMN1P16949 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STMN1P16949 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
STMN1P16949 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STMN1P16949 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STMN1P16949 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STMN1P16949 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STMN1P16949 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STMN1P16949 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STMN1P16949 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STMN1P16949 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STMN1P16949 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STMN1P16949 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STMN1P16949 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STMN1P16949 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STMN1P16949 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STMN1P16949 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STMN1P16949 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STMN1P16949 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STMN1P16949 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STMN1P16949 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STMN1P16949 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STMN1P16949 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STMN1P16949 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STMN1P16949 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STMN1P16949 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STMN1P16949 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STMN1P16949 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STMN1P16949 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STMN1P16949 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STMN1P16949 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STMN1P16949 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STMN1P16949 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STMN1P16949 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STMN1P16949 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STMN1P16949 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STMN1P16949 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STMN1P16949 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STMN1P16949 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STMN1P16949 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
STMN1P16949 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STMN1P16949 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STMN1P16949 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STMN1P16949 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STMN1P16949 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STMN1P16949 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STMN1P16949 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STMN1P16949 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STMN1P16949 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STMN1P16949 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STMN1P16949 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
STMN1P16949 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STMN1P16949 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STMN1P16949 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STMN1P16949 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STMN1P16949 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STMN1P16949 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STMN1P16949 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STMN1P16949 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STMN1P16949 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STMN1P16949 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STMN1P16949 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
STMN1P16949 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STMN1P16949 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STMN1P16949 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STMN1P16949 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STMN1P16949 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STMN1P16949 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STMN1P16949 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STMN1P16949 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
STMN1P16949 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STMN1P16949 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STMN1P16949 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STMN1P16949 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STMN1P16949 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STMN1P16949 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STMN1P16949 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STMN1P16949 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STMN1P16949 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STMN1P16949 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STMN1P16949 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
STMN1P16949 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STMN1P16949 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms