Protein–RNA interactions for Protein: P11940

PABPC1, Polyadenylate-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1P11940 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PABPC1P11940 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PABPC1P11940 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PABPC1P11940 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PABPC1P11940 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PABPC1P11940 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PABPC1P11940 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PABPC1P11940 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PABPC1P11940 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PABPC1P11940 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PABPC1P11940 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PABPC1P11940 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PABPC1P11940 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PABPC1P11940 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PABPC1P11940 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PABPC1P11940 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PABPC1P11940 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PABPC1P11940 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PABPC1P11940 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PABPC1P11940 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PABPC1P11940 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PABPC1P11940 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PABPC1P11940 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PABPC1P11940 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PABPC1P11940 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PABPC1P11940 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PABPC1P11940 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PABPC1P11940 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PABPC1P11940 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PABPC1P11940 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PABPC1P11940 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PABPC1P11940 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PABPC1P11940 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PABPC1P11940 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PABPC1P11940 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PABPC1P11940 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PABPC1P11940 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PABPC1P11940 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
PABPC1P11940 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PABPC1P11940 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PABPC1P11940 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PABPC1P11940 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PABPC1P11940 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PABPC1P11940 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PABPC1P11940 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PABPC1P11940 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PABPC1P11940 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PABPC1P11940 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PABPC1P11940 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PABPC1P11940 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PABPC1P11940 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.9 ms