Protein–RNA interactions for Protein: P0DME0

SETSIP, Protein SETSIP, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETSIPP0DME0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETSIPP0DME0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 762.7 ms