Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC159P0C7I6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.2 ms