Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBB4AP04350 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBB4AP04350 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBB4AP04350 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBB4AP04350 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBB4AP04350 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBB4AP04350 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBB4AP04350 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBB4AP04350 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBB4AP04350 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBB4AP04350 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBB4AP04350 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBB4AP04350 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBB4AP04350 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBB4AP04350 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBB4AP04350 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBB4AP04350 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBB4AP04350 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBB4AP04350 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBB4AP04350 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBB4AP04350 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBB4AP04350 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBB4AP04350 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB4AP04350 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB4AP04350 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB4AP04350 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB4AP04350 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB4AP04350 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBB4AP04350 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBB4AP04350 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBB4AP04350 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBB4AP04350 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBB4AP04350 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBB4AP04350 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBB4AP04350 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBB4AP04350 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBB4AP04350 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBB4AP04350 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBB4AP04350 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBB4AP04350 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBB4AP04350 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.3 ms