Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TOP3BO95985 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TOP3BO95985 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOP3BO95985 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOP3BO95985 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOP3BO95985 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOP3BO95985 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOP3BO95985 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOP3BO95985 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOP3BO95985 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOP3BO95985 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOP3BO95985 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOP3BO95985 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOP3BO95985 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOP3BO95985 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOP3BO95985 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOP3BO95985 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOP3BO95985 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOP3BO95985 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOP3BO95985 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP3BO95985 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP3BO95985 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP3BO95985 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP3BO95985 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP3BO95985 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP3BO95985 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP3BO95985 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP3BO95985 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP3BO95985 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP3BO95985 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP3BO95985 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP3BO95985 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP3BO95985 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP3BO95985 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP3BO95985 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP3BO95985 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP3BO95985 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP3BO95985 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP3BO95985 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms