Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB6O95452 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB6O95452 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB6O95452 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB6O95452 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB6O95452 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB6O95452 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB6O95452 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB6O95452 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB6O95452 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB6O95452 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB6O95452 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB6O95452 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB6O95452 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB6O95452 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB6O95452 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB6O95452 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB6O95452 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB6O95452 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB6O95452 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB6O95452 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB6O95452 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB6O95452 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB6O95452 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB6O95452 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB6O95452 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB6O95452 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB6O95452 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB6O95452 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB6O95452 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB6O95452 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB6O95452 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB6O95452 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB6O95452 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB6O95452 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB6O95452 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB6O95452 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB6O95452 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB6O95452 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB6O95452 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB6O95452 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB6O95452 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB6O95452 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB6O95452 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB6O95452 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB6O95452 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB6O95452 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB6O95452 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB6O95452 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB6O95452 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB6O95452 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB6O95452 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB6O95452 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB6O95452 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB6O95452 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB6O95452 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GJB6O95452 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJB6O95452 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJB6O95452 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJB6O95452 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJB6O95452 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJB6O95452 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GJB6O95452 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJB6O95452 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB6O95452 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB6O95452 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB6O95452 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB6O95452 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB6O95452 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJB6O95452 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJB6O95452 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJB6O95452 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJB6O95452 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJB6O95452 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJB6O95452 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJB6O95452 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJB6O95452 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJB6O95452 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB6O95452 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB6O95452 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB6O95452 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB6O95452 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB6O95452 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB6O95452 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB6O95452 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB6O95452 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB6O95452 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB6O95452 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB6O95452 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB6O95452 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB6O95452 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB6O95452 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB6O95452 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB6O95452 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB6O95452 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB6O95452 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB6O95452 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB6O95452 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB6O95452 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB6O95452 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 260.9 ms