Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP19O94966 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP19O94966 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP19O94966 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
USP19O94966 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
USP19O94966 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
USP19O94966 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
USP19O94966 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
USP19O94966 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
USP19O94966 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
USP19O94966 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
USP19O94966 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
USP19O94966 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
USP19O94966 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
USP19O94966 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
USP19O94966 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
USP19O94966 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
USP19O94966 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
USP19O94966 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
USP19O94966 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
USP19O94966 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
USP19O94966 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
USP19O94966 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
USP19O94966 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
USP19O94966 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
USP19O94966 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
USP19O94966 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
USP19O94966 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
USP19O94966 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
USP19O94966 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
USP19O94966 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
USP19O94966 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
USP19O94966 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC32■■■□□ 2.71
USP19O94966 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
USP19O94966 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
USP19O94966 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
USP19O94966 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
USP19O94966 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
USP19O94966 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
USP19O94966 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
USP19O94966 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
USP19O94966 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
USP19O94966 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
USP19O94966 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
USP19O94966 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
USP19O94966 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
USP19O94966 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
USP19O94966 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
USP19O94966 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
USP19O94966 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
USP19O94966 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
USP19O94966 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
USP19O94966 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
USP19O94966 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
USP19O94966 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
USP19O94966 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
USP19O94966 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
USP19O94966 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
USP19O94966 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
USP19O94966 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
USP19O94966 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
USP19O94966 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
USP19O94966 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
USP19O94966 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
USP19O94966 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
USP19O94966 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
USP19O94966 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
USP19O94966 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
USP19O94966 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
USP19O94966 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
USP19O94966 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
USP19O94966 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
USP19O94966 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
USP19O94966 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
USP19O94966 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
USP19O94966 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
USP19O94966 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
USP19O94966 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
USP19O94966 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
USP19O94966 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
USP19O94966 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
USP19O94966 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
USP19O94966 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
USP19O94966 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
USP19O94966 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
USP19O94966 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
USP19O94966 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
USP19O94966 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
USP19O94966 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
USP19O94966 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
USP19O94966 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
USP19O94966 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
USP19O94966 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
USP19O94966 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
USP19O94966 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
USP19O94966 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
USP19O94966 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
USP19O94966 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
USP19O94966 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
USP19O94966 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms